Не совсем понимаю о чем идет речь, если отличается, то чем? Рассуждаю примерно так, есть погружной насос и холодильник которым нужен чистый синус, от генератора они работают, на входе инвертора индикатор показывает входное напряжение 47 Гц, напряжение 212 В
Допустимый диапазон частоты сети в режиме трансляции при
отключенном контроле синусоидальности, Гц * (45-49)
Таким образом, в инструкции допускается, вообще, отключать контроль синусоиды.
Нагрузку я не подключал, если не считать лампочки 5 Вт. Есть встроенное трехстадийное зарядное устройство 2-8 А, впрочем, это в допуске
Иными словами, ничего, что могло бы дать хоть какую-нибудь зацепку, кроме того, что генератор 2.5 кВт, а пусковая мощность инвертора 4 кВт. .
Может быть в этом причина? Другого объяснения не могу найти, ну, кроме желания завить о большем имея меньшее.

 То, что они работают, не говорит о том, что генератор выдает чистый синус.
 
А это уже говорит о том, что частота на выходе генератора не 50 Гц, что косвенным образом говорит о том, что и форма сигнала там - не чистый синус.
 
Исходя из этого, форма сигнала не должна влиять на работу инвертора от генератора.
Судя по всему, речь идет о российском чуде техники под маркой А-электроника. Единственное, что могу еще порекомендовать - это проверить инвертор, подключив его к обычной сети, а не к генератору. Может быть он вообще не работает. 
Более подсказать ничего не могу - обращайтесь к производителю или к продавцу инвертора.

К сожалению проверить от сети не могу, ее нет, но от АКБ работает.


 

Кроме того, что генератор должен быть большой мощности они больше ничего не говорят.
Знать бы наперед, что там на самом деле.